عادة ما يكون الرقم الهيدروجيني للبراز متعادلًا أو قلويًا قليلاً (6.8 - 7.5). قد يشير المزيد من البراز الحمضي ، الفسيولوجي فقط في حديثي الولادة ، إلى التهابات معوية (الإشريكية القولونية ، الفيروسة العجلية) أو اضطرابات الجهاز الهضمي ، مثل اللاكتوز أو عدم تحمل الدهون (الإسهال الدهني بسبب قصور البنكرياس أو ركود القنوات الصفراوية).
يتأثر الرقم الهيدروجيني للبراز بالعادات الغذائية للموضوع ؛ على سبيل المثال ، الأنظمة الغذائية الغنية باللحوم ومنتجات الألبان تجعل البراز أكثر قلوية. في الواقع ، تعمل الفلورا البكتيرية المعوية المتعفنة على هدم الأحماض الأمينية التي أفلتت من الامتصاص ، وتولد الأمينات السامة وذات الرائحة الكريهة ؛ وبالتالي ، يميل الرقم الهيدروجيني للبراز إلى الزيادة نتيجة لزيادة إنتاج الأمونيا. لذلك ليس من قبيل المصادفة أن درجة حموضة البراز شديدة القلوية ، مصحوبة بانخفاض في الأحماض الدهنية قصيرة السلسلة (انظر الزبدات) ، قد ارتبطت بزيادة خطر الإصابة بسرطان القولون والمستقيم.
إذا كان الرقم الهيدروجيني للبراز يميل إلى الزيادة في وجود خلل التنسج المتعفن ، فإنه يميل إلى الانخفاض في وجود خلل التنسج المخمر ، والذي يمكن العثور على أسبابه في الإفراط في تناول الكربوهيدرات أو في سوء امتصاص نفس ( مرض الاضطرابات الهضمية). حتى في حالة وجود "كمية كبيرة من الدهون ، في النظام الغذائي النباتي وفي الصيام لفترات طويلة ، يصبح الرقم الهيدروجيني للبراز حامضيًا.
لتجنب تشويه نتائج الاختبار ، يجب عدم تلوث البراز بالبول ويجب تبريده بسرعة لمنع الأمونيا البولية والبكتيريا المتعفنة من جعل درجة الحموضة في البراز قلوية.